Program Studi Magister Ilmu Lingkungan (PS MIL) Universitas Tanjungpura berdiri sejak tahun 2013 berdasarkan Surat Keputusan Kementerian Riset, Teknologi, dan Pendidikan Tinggi Nomor 630/E.E2/DT/2013 tanggal 10 Juli 2013. Sejak awal, PS MIL dikembangkan sebagai program magister interdisiplin untuk menjawab kompleksitas permasalahan lingkungan melalui integrasi berbagai bidang ilmu.
PS MIL menyelenggarakan pendidikan yang menghubungkan aspek ekologi, sumber daya alam, sosial, ekonomi, teknologi, kebijakan, dan tata kelola lingkungan. Pembelajaran diarahkan untuk membangun kemampuan mahasiswa dalam memahami sistem lingkungan, melakukan penelitian, menganalisis permasalahan dan kebijakan, serta mengembangkan solusi berbasis data untuk mendukung pengelolaan lingkungan dan pembangunan berkelanjutan.Dalam perkembangannya, PS MIL terus memperkuat kualitas pembelajaran, penelitian, pengabdian kepada masyarakat, dan jejaring kolaborasi dengan berbagai mitra di tingkat lokal, nasional, dan internasional.